La investigación y la innovación son procesos misionales del HUSI, hacen parte del eje de responsabilidad social. Mediante las actividades de investigación e innovación se promueve el desarrollo del país; la generación, la apropiación y trasformación de conocimientos que contribuyen a mejorar las condiciones de vida de los pacientes, sus familias y las comunidades. La Oficina de Investigaciones depende de la Dirección Científica y tiene como objetivo principal: Implementar las estrategias de fortalecimiento de los procesos de investigación, desarrollo e innovación, en alianza con la Pontificia Universidad Javeriana, para el logro de los objetivos estratégicos institucionales, con adherencia a la buena práctica clínica en investigación y a las demás normas nacionales e internacionales en ética e integridad científica.